MetaInsight

Análise de Comunidades Microbianas

Lê a comunidade inteira, não apenas os residentes.

Preço sob consulta
ISO 17025 DESDE 2014 12 PAÍSES UE

Diversidade, estrutura, função — a comunidade inteira numa só análise.

O QUE É

Caracterização do Microbioma de Matrizes Ambientais

O MetaInsight caracteriza a comunidade microbiana de amostras ambientais — solo, água, sedimentos — por metabarcoding (16S rRNA para bactérias e ITS para fungos) e/ou metagenómica shotgun. A combinação de sequenciação robusta com pipelines bioinformáticos reprodutíveis dá uma visão detalhada da composição microbiana, da riqueza e do potencial funcional ecológico.

O serviço apoia aplicações em agricultura sustentável, monitorização ambiental, biotecnologia e avaliação da qualidade ecológica.

VIAS

Três Vias Sobre a Mesma Amostra

Metabarcoding — barcode único Perfil de diversidade bacteriana (16S rRNA) OU fúngica (ITS) da amostra. Ideal para: questões dirigidas de diversidade num único reino.
Metabarcoding — duplo barcode Perfis de diversidade bacteriana E fúngica na mesma submissão. Ideal para: visão completa procariota + eucariota a nível de amplicons.
Metagenómica shotgun DNA de toda a comunidade: bactérias, fungos, arqueias e vírus, com anotação funcional. Ideal para: estrutura + função numa única análise.
O QUE RECEBE
  • Extração de DNA das suas amostras ambientais (solo, água, etc.)
  • Sequenciação na nossa parceira (BMKGENE) com cadeia de custódia completa
  • Análise bioinformática com pipelines estabelecidos e reprodutíveis
  • Relatório à medida da pergunta que nos traz
PRAZO ≤40 Dias úteis

Da receção da amostra ao relatório final. Inclui sequenciação externa e bioinformática.

PREÇO Sob consulta

Depende do número de amostras e da profundidade da pergunta. Contacte-nos para um orçamento à medida.

FAQ

Perguntas Frequentes

Qual a diferença entre metabarcoding e metagenómica shotgun?

O metabarcoding sequencia um único marcador taxonómico (16S para bactérias, ITS para fungos) e dá-lhe um perfil de diversidade desse grupo. A metagenómica shotgun sequencia o DNA de toda a comunidade e recupera bactérias, fungos, arqueias e vírus, com informação funcional — a um custo por amostra mais elevado e com prazo mais longo.

Posso analisar bactérias e fungos em conjunto?

Sim — pode encomendar metabarcoding só para bactérias, só para fungos ou ambos na mesma submissão. O preço escala em conformidade.

Quanto tempo demora a análise?

Até 40 dias úteis. O fluxo inclui extração de DNA, sequenciação na nossa parceira, processamento bioinformático e a redação do relatório — esta última etapa escala com a profundidade da pergunta que nos traz.

Como é o relatório?

É um relatório à medida da pergunta. No metabarcoding focamo-nos em índices de diversidade, composição taxonómica e comparações entre grupos. Na metagenómica shotgun acrescentamos vias funcionais, como ciclagem de nutrientes, degradação de matéria orgânica e biossíntese de antibióticos.

Pronto para começar?

Envie-nos as suas amostras, partilhe as suas questões de investigação, ou fale-nos do seu projeto. Desenhamos o protocolo de análise adequado.

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